프린세스 프린세스 히메들의 위험한 방과 후

'Princess Princess'는 남학교이자 지역 내 가장 엘리트 학교인 곳에서 여장을 하도록 선발된 세 소년의 삶을 다룬 이야기입니다. 주인공인 코노 토루는 삼촌과 한동안 지낸 뒤, 새로운 남학교인 후지모리 학원으로 전학을 왔습니다. 그는 학교의 전통에 따라 '히메(姫, 공주)' 중 한 명으로 선발되는데, 이는 온통 남학생뿐인 단조로운 학교생활에 활력을 불어넣기 위한 것입니다. (일정한 자격을 갖춘) 학생들은 공주로 선발되어 여장을 하고 이와 같은 학교 행사에 참여하게 됩니다.
이야기가 시작될 시점에는 이미 시호다니 유우지로와 유타카 미코토라는 두 명의 공주가 있으며, 각각 기숙사 위치에 따라 서쪽 공주와 동쪽 공주로 불립니다. 토루는 전학 직후 설득 끝에 공주 역할을 맡게 되지만, 막상 수락하고 나니 생각보다 훨씬 즐겁다는 것을 알게 됩니다.